Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpa33Q9JKA5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms