Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms