Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms