Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms