Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabarapQ9DCD6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms