Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms