Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift43Q9DA69 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms