Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms