Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc52a2Q9D8F3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms