Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms