Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm3404Q9D506 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm3404Q9D506 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm3404Q9D506 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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