Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PrameQ9D4Z5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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PrameQ9D4Z5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PrameQ9D4Z5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PrameQ9D4Z5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PrameQ9D4Z5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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PrameQ9D4Z5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrameQ9D4Z5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms