Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SarnpQ9D1J3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SarnpQ9D1J3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms