Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl53Q9D1H8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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