Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acbd6Q9D061 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acbd6Q9D061 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms