Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MtrexQ9CZU3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MtrexQ9CZU3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms