Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis18aQ9CZJ6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms