Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx7Q9CY18 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms