Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RpainQ9CWY9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RpainQ9CWY9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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