Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rdm1Q9CQK3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdm1Q9CQK3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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