Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms