Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlr3Q99MB1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr3Q99MB1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms