Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q99M08 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q99M08 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q99M08 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q99M08 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q99M08 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q99M08 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms