Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp16Q99LG0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms