Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dok4Q99KE3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dok4Q99KE3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms