Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nle1Q8VEJ4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nle1Q8VEJ4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms