Protein–RNA interactions for Protein: Q8R526

Pkd1l1, Polycystic kidney disease protein 1-like 1, mousemouse

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Length 2,615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l1Q8R526 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkd1l1Q8R526 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkd1l1Q8R526 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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