Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitrm1Q8K411 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitrm1Q8K411 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms