Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms