Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms