Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edc3Q8K2D3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edc3Q8K2D3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms