Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Znf628Q8CJ78 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf628Q8CJ78 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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