Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms