Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx8Q8CFD4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx8Q8CFD4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx8Q8CFD4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx8Q8CFD4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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