Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms