Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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