Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms