Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp20Q8C6M1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms