Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccz1Q8C1Y8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccz1Q8C1Y8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms