Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atg16l1Q8C0J2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Atg16l1Q8C0J2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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