Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms