Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubash3bQ8BGG7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms