Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms