Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LnpkQ7TQ95 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms