Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smap2Q7TN29 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms