Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms