Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms