Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme8Q715T0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme8Q715T0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms