Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms