Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb10Q6XAR7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ssxb10Q6XAR7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssxb10Q6XAR7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssxb10Q6XAR7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssxb10Q6XAR7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxb10Q6XAR7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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